菌落總數(shù)通常用來判斷食品被微生物細菌污染的程度，菌落總數(shù)的多少一般標志著食品衛(wèi)生質(zhì)量的好壞。食品菌落總數(shù)超標，說明食品致病菌污染幾率增加，而這種食品很大幾率會危害食用者的身體健康。食品不同的種類有著不同的食品安全認證，菌落總數(shù)的限量也根據(jù)食物的原材料、生產(chǎn)加工工藝等的不同而有一定的差異。

    從衛(wèi)生角度來說，超過了菌落總數(shù)標準，就會被列入衛(wèi)生不合格產(chǎn)品。如果菌落總數(shù)超標嚴重，可能會造成腹瀉。

    上海市市場監(jiān)督管理局抽檢發(fā)現(xiàn)，標稱河南豫道農(nóng)業(yè)科技發(fā)展有限公司生產(chǎn)的重慶小面（非油炸方便面）（面餅+配料135克 面餅65克/盒，豫道食品，2022-02-11）菌落總數(shù)不合格，檢驗結(jié)果為6.3×10?CFU/g,4.3×10?CFU/g,5.2×10?CFU/g,5.9×10?CFU/g,6.1×10?CFU/g，標準值為n=5,c=2,m=10?,M=10?CFU/g。

    ATP熒光檢測儀能夠快速檢測食品中菌落總數(shù)，國內(nèi)菌落總數(shù)檢測儀器有很多方法學儀器；普遍使用的儀器就是ATP熒光檢測儀。

    ATP熒光檢測儀用途廣泛，可用于食品、醫(yī)藥衛(wèi)生、醫(yī)藥、日化、造紙、工業(yè)水處理、國防以及環(huán)保、水政、海關(guān)出入境檢疫及其他執(zhí)法部門等多種行業(yè) 。

    ATP熒光檢測儀基于螢火蟲發(fā)光原理，利用“熒光素酶—熒光素體系”快速檢測三磷酸腺苷（ATP）。由于所有生物活細胞中含有恒量的ATP，所以ATP含量可以清晰地表明樣品中微生物與其他生物殘余的多少，用于判斷衛(wèi)生狀況。